转录复合物在DNA复制过程中是否仍能与DNA保持结合的关系。如果是这样，它将作为一种生物记忆，允许子细胞继承

亲本细胞的基因表达模式。为了验证此想法，可在非洲瓜蛙(Xenopus)5SRNA基因上装配一个有活性的转录复合物，而Xenopus 5SRNA基因本身存在于质粒中，诱导它进行复制，然后在复制的基因上检测转录。这些步骤都可在体外实现。

为了区别复制和未复制的模板，利用限制性核酸内切酶(DpnI，MboI和ScuBA)，它们对于所识别序列GATC的甲基化的敏感性不同(如图13-3-52所示)。这个序列一旦在5SRNA的起始处出现，并且如果DNA在这个位点被切割，转录就不能发生。如果模板在野生型大肠杆菌复制，GATC序列的两条链中的A都被细菌中的Dam甲基化酶甲基化，完全甲基化DNA在体外的复制产生子代双螺旋，在第一轮复制中，只有一条链被甲基化，而在以后的复制循环中DNA就无甲基化。你的想法起始于完全甲基化DNA和诱导它在体外进行复制，然后分析用DpnI处理过的复制DNA上的转录。DpnI只切割未复制的完全甲基化DNA，但是它不能切割复制的DNA。因而它对转录有保护作用。

为了验证方案是否起作用，可构建一个比正常的5SRNA基因略长的基因(大基因)，它的RNA转录产物与正常5SRNA基因的转录产物很容易区别(如图13-3-52A所示)。然后将完全甲基化的大基因同甲基化或未甲基化的正常基因混合，在用DpnI、MboI和Sau3A消化前后分别检查它们的转录。限制性内切酶的专一性如图13-3-52A所示。为了验证复制对转录的影响，在完全甲基化的大基因上装配一个转录复合物，诱导复制，并在用限制性内切酶作用前后分别检查转录活性，结果如图13-3-52B所示。