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一条DNA有105个核苷酸残基，它的碱基组成为：A 21%，G 29%，C 29%及T 21%，经DNA聚合酶复制得互补链。生成的双螺旋DNA为RNA聚合酶的模板，转录后得到有相同数目残基的新RNA链。
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图Q2.3研究大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ校正功能的人工底物黑体字母表示被放射性标记的核苷酸
图Q2.4 DNA聚合酶Ⅰ在不含dTTP(a)和含有dTTP(b)时的校正功能
E.coli DNA的分子量为2.7×109U，如果所有的核苷酸序列都用来编码蛋白质，它对应多少个平均大小的蛋白质(蛋白质的平均分子量为50000U，氨基酸残基的平均分子量为110U)。
pXpApYpZ→Xp+Ap+Yp+…
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这样，从Ap、Gp、Cp和Tp得到的放射性标记相对量就分别表示在合成的DNA中二核苷酸ApA、GpA、CpA和TpA的相应频率。在合成反应中用另一种标记的三磷酸，如α-32P-dTTP，则可得到ApT、GpT、CpT和TpT的频率。依此类推，可得到所有16种可能的二核苷酸的频率。对于某一特定的DNA分子，一些最邻近频率为：ApG，0.15；GpT，0.03；GpA，0.08；TpT，0.10。在每种情况下最邻近碱基均按5'→3'方向书写。
用Maxam-Gilbert法测定单链DNA分子的核苷酸顺序。一份DNA样品进行四种不同处理。
(1)DNA与硫酸二甲酯反应，该试剂使G和A都甲基化．但与G的反应快5倍。然后加热DNA，这样可除去甲基化的G和A残基。然后加碱，这时与甲基化碱基相连的糖从两侧的磷酸二酯键上断裂下来。
(2)如第1步中用硫酸二甲酯处理后将DNA放入稀酸溶液；这种处理使A优先脱落。在碱性条件下DNA的磷酸二酯键断裂。
(3)DNA与肼反应，再用吡啶处理。和第1和第2步的结果一样，磷酸二酯键发生断裂，但在T和C部位断裂频率相同。
(4)在2mol/LNaCl中进行第3步处理；这样可防止T处的断裂。这几步反应控制在每50个碱基中有一个发生甲基化或肼解反应。进行彻底水解反应。每组反应混合物由一组片段组成，它们的长度由特定碱基的位置决定。聚丙烯酰胺凝胶电泳可将每组混合物中的片段根据长度进行分离。通常DNA末端用32P标记，这样凝胶中的片段可以用放射自显影定位。根据每个位置上带的密度可以从凝胶上读出顺序。须注意的是带的位置可确定碱基的部位，但是带的密度与断裂的几率有关。图2-3-49显示某样品的有关图谱。
