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[主观题]

BamH I的识别位点是5-GGATCC-3,切割位点在第一个G的右侧,Sau3A工的识别序列是5-GATC-3,在G的左侧

切割,(1)写出两限制酶切割DNA后所产生的DNA分子末端。(2)如用T4 DNA连接酶将两片段相连,能否连接在一起?(3)该连接的杂合位点可被以上两种酶切割吗?

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第1题
人类基因组DNA经过Sau3A(G↓ATC)部分酶切后,连接到载体pCU999的BamHⅠ位点上 (G↓GATCC)。BamHⅠ位于

人类基因组DNA经过Sau3A(G↓ATC)部分酶切后,连接到载体pCU999的BamHⅠ位点上 (G↓GATCC)。BamHⅠ位于多克隆位点的SalⅠ和NotⅠ之间,二者距离20 bp。 (1)从文库中分离出某克隆(克隆1),分别用NotⅠ(N)、SalⅠ(S)或SalⅠ十NotⅠ(S十N)酶切后,电泳分离并用EB染色。DNA转移到膜上后,用载体上的DNA作为探针进行杂交,结果如下图所示:

假设同源序列50 bp以下则无杂交信号。在此基因组DNA上标上所有的SalⅠ和NotⅠ位点,标明酶切位点间距离。 (2)从同样的文库中分离到带有重叠片段的克隆(克隆2),用同样的酶切、电泳、转膜后,以克隆1的DNA为探针(包括基因组DNA和载体DNA)进行southern杂交,结果如下图所示:

画出克隆2的图,标明所有SalⅠ和NotⅠ位点及位点间距离。 (3)所有的人类基因组DNA都用SalⅠ酶切,并用来自于克隆1或克隆2的DNA为探针作Southern杂交,结果如下图所示:

其中6个SalⅠ切点的位置可以用以上的结果来确定。请画出这一区域的SalⅠ位点图。

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第2题
一个癌基因,从序列上看似乎编码一个转录因子。当放在细胞中表达时,该基因的产物是完全不溶的,这影响了对其功
能的直接检测。免疫染色表明,这种蛋白质定位于细胞核内,如同推测的一样,是一种转录因子。如果能够测出它所结合的DNA序列,就可以从现有的序列资料中查找已知基因启动子的天然位点,从而能够找到它所调节的基因。

有人建议用PCR扩增同该蛋白质结合的微量DNA,思路是(图Q25.8):①合成一组长为26个碱基的随机序列的寡聚核苷酸混合体,在该序列的两侧各有一段25个碱基的序列作为PCR扩增的引物位点[图Q25.8(a)];②把这些寡聚核苷酸加到含有转录因子的细胞粗提取物中,转录因子可以同含有结合位点的寡聚核苷酸结合;③用转录因子特异的抗体分离同转录因子结合的寡聚核苷酸;④用PCR扩增选择到的寡聚核苷酸进行序列分析。

图Q25.8 用随机的寡聚核苷酸选择和扩增特异的DNA序列(a)用于选择的原初随机序列的寡聚核苷酸,N代表任何一种核苷酸;EcoR Ⅰ和BamH Ⅰ位点有利于选择DNA的克隆和序列分析。(b)同序列特异的DNA结合蛋白结合的寡聚核苷酸的选择和序列分析方案按照这一思路,用0.2ng单链随机序列的寡聚核苷酸开始了这项实验,这个寡聚核苷酸可以同一个PCR引物结合成部分双链,经过如图Q25.8(b)所示的四轮选择和复制后,用BamH Ⅰ和EcoR Ⅰ消化分离到的DNA,将片段克隆到质粒中,并测定了10个独立的克隆(表Q25.1),问:

表Q25.1 10个克隆的序列

注:画线的序列是PCR引物部位,两种序列都是从BamH Ⅰ末端开始,所有序列中结合位点的方向都是相同的。

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第3题
Ⅰ型限制酶的识别与切割位点常分散于1000bp中,如果I型酶识别半甲基化DNA,DNA将完全甲基化。相反,如果遇到非甲
基化DNA,它将通过ATP水解供能切除DNA。
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第4题
入噬菌体的线性基因组DNA两端各有一段20个碱基长的单链突出,它们是可以互补的黏性末端,可以连接
起来,使DNA环化。在试管中分别对线性和环状DNA进行限制酶切割 (EcoRⅠ、BarnHⅠ或同时用二者),结果如下页图所示: (1)哪个样品是环状DNA分子? (2)线形DNA总长度是多少? (3)环状DNA的总长度是多少? (4)画出线形DNA的限制酶酶切图谱,标明EcoRⅠ和BamHⅠ所有位点。

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第5题
在下列限制性内切核酸酶中,( )的识别序列中有松弛碱基,选用这种酶时要考虑连接后外源DNA的插入方向。

A.Hind Ⅲ

B. EcoR Ⅱ

C. BamH Ⅰ

D. Pst Ⅰ

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第6题
从E.coli中分离到一种hemA突变体,这种突变是不可恢复的,并且需要生长在琥珀酸的平板上才能利用δ-氨基乙酰丙
酸合成血红素。希望利用该突变体去克隆E.coli的hemA基因。首先用Sau3A Ⅰ部分酶切E.coli的DNA,得到的DNA片段平均为2kb,然后将这些片段从BamH Ⅰ位点克隆到质粒pBR322中,连接后转化hemA突变体。根据氨苄青霉素抗性来选择重组体。将筛选到的氨苄青霉素抗性克隆重植在加有δ-氨基乙酰丙酸的平板上进行测试。请问:已经测试的Ampr抗性转化子中有多少不再需要在培养基中添加琥珀酸?(E.coli基因组的全长为4500kb。)
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第7题
Ⅰ类限制酶识别DNA的位点和切割的DNA位点是不同的,切割位点的识别结合有两种模型,一种是______,另一种是____
__。
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第8题
Ⅲ型限制酶:

A.由两个仅识别半甲基化位点的亚基组成,甲基化位点相对于限制性位点的位置决定DNA是被甲基化还是被限制。

B.具甲基化与限制活性,依赖于亚基识别位点。MS促进甲基化,R促进限制性。

C.由加强识别和甲基化或限制性的两个亚基组成,接近识别位点。

D.主要功能是错配修复,因为DNA结合是根据构象扭转而不是序列错误的识别。

E.是一种光依赖酶,对于嘧啶二聚体的光复活很重要。因为它能切除相邻嘧啶碱基交联的共价键。

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第9题
限制性内切酶的识别位点通常是______个碱基对。
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第10题
部分酶切是指控制反应条件,使得酶在DNA序列上的识别位点只有部分得到切割,它的理论依据是______。
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第11题
以下哪些关于限制酶的说法是正确的。

A.限制酶是外切酶,而不是内切酶。

B.限制酶在特异性序列,即识别位点切割DNA。

C.限制酶能切割DNA而产生一致的末端序列。

D.一些限制酶在其识别位点切割两条DNA链的位置略有不同,形成粘端。

E.一些限制酶在其识别位点切割两条DNA链的位置略有相同,形成钝端。

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